马克思主义学院主要承担全校思想政治理论课教学、有关人文社会科学课程教学、大学生心理健康教育和思想政治教育专业硕士研究生培养等任务。下设思想道德与法治、中国近现代史纲要、马克思主义基本原理、毛泽东思想和中国特色社会主义理论体系概论、习近平新时代中国特色社会主义思想概论、形势与政策、研究生思想政治理论课等7个教研室和心理发展中心等机构。学院现有药学教育学专业1个博士点，思想政治教育专业、药学教育学专业2个硕士点。有江苏省大学生心理健康教育与研究示范中心1个。现有教师54人，其中教授4人，副教授/副研究员13人。

在校党政正确领导下，马克思主义学院落实立德树人根本任务，坚持“马院姓马、在马言马”的办学原则，以思政课教学为中心，以科研为动力，不断深化学院内涵建设。近年来，学院承担国家社科基金、国家社科基金后期资助项目、国家社科基金重大课题子课题、教育部人文社科青年基金项目等课题20余项。多门课程获得学校教学成果奖或被评为优秀课程，多名教师在全国高校思想政治理论课教学展示、省级思政课教学竞赛中获特等奖等奖项近10项。思政课教改成果多次被新华网、学习强国、《中国教育报》《江苏教育报》等主流媒体报道。在学校“吾爱吾师”评选活动中，连续9人次被评为学生最受欢迎教师。在建设药学特色世界一流研究型大学、培养新时代担当民族复兴大任药界英才的征程中，马克思主义学院正在发挥日益重要的作用。